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2025-05-16 03:30:35多肽文庫(kù)構(gòu)建: 多肽文庫(kù)構(gòu)建是一種合成大量具有序列多樣性的多肽集合的技術(shù)。它通過(guò)在固定位置上引入不同的氨基酸殘基，生成一系列具有不同序列的多肽。這些多肽可以用于藥物篩選、疫苗開發(fā)、疾病診斷等領(lǐng)域。通過(guò)高通量合成與篩選，可以快速鑒定出具有特定生物活性的多肽分子，加速新藥研發(fā)進(jìn)程。多肽文庫(kù)構(gòu)建技術(shù)具有高度的靈活性和可定制性，能夠滿足不同研究需求，是現(xiàn)代生物醫(yī)學(xué)研究中的重要工具。

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多肽文庫(kù)構(gòu)建問(wèn)答

2023-06-16 14:28:25構(gòu)建表達(dá)載體想降本增效？看這一篇就夠了: 想要開發(fā)有穩(wěn)定生產(chǎn)能力的細(xì)胞株，除了在細(xì)胞開發(fā)中對(duì)于細(xì)胞表達(dá)能力的評(píng)估篩選以外，前期的表達(dá)載體的構(gòu)建過(guò)程也非常重要。使用納升移液技術(shù)可以顯著提高細(xì)胞株過(guò)程基因合成，表達(dá)載體構(gòu)建以及轉(zhuǎn)染篩選等實(shí)驗(yàn)的實(shí)驗(yàn)效率，降低實(shí)驗(yàn)成本。聲波移液展示Echo?移液系統(tǒng)依靠專利技術(shù)（U.S. Patent 6938995）和創(chuàng)新方法改變移液操作在整個(gè)生命科學(xué)領(lǐng)域中的應(yīng)用。它采用動(dòng)態(tài)液體分析（Dynamic Fluid Analysis?, DFA）技術(shù)和聲波移液（Acoustic Droplet Ejection，ADE）技術(shù)，讓研究人員能夠移取多種不同類型的液體，完成微量小體積（2.5/25nL）的移液工作。全流程無(wú)需槍頭耗材，無(wú)交叉風(fēng)險(xiǎn)。納升移液技術(shù)讓細(xì)胞株構(gòu)建更快、更準(zhǔn)、更經(jīng)濟(jì)更快—— Echo快速任意孔到任意孔移液，極速基因組裝在質(zhì)粒構(gòu)建前期，需要非常多的準(zhǔn)備實(shí)驗(yàn)，如基因組裝中將不同的DNA片段混合，在檢測(cè)反應(yīng)中將不同的樣本組合，在NGS文庫(kù)構(gòu)建過(guò)程中將多個(gè)文庫(kù)pooling到一起，在CRISPr基因編輯中構(gòu)建sgRNA文庫(kù)等等，這些實(shí)驗(yàn)都需要進(jìn)行快速、靈活的加樣移液，就算使用高通量的移液工作站，往往也要好幾小時(shí)才能完成。納升移液技術(shù)Echo的任意孔到任意孔的快速移液特點(diǎn)則讓此類應(yīng)用簡(jiǎn)單、快速化，每次轉(zhuǎn)移花費(fèi)更少時(shí)間更短。這為基因組裝節(jié)省了高達(dá)82%的時(shí)間。從母板任意孔轉(zhuǎn)移任意體積樣品到目標(biāo)板任意孔中，實(shí)現(xiàn)快速挑選、樣品混合和組合。有效縮短實(shí)驗(yàn)周期更準(zhǔn)—— Echo加樣精準(zhǔn)，提高克隆效率利用質(zhì)粒上含有的抗性選擇進(jìn)行篩選，需要對(duì)篩選結(jié)果進(jìn)行鑒定，而qPCR也是常用的鑒定方法之一。使用Echo納升移液技術(shù)進(jìn)行微量化克隆篩選鑒定，可以以更少的實(shí)際成本精準(zhǔn)完成實(shí)驗(yàn)。使用Echo完成 qPCR的反應(yīng)體系構(gòu)建，通過(guò)減少每個(gè)組件的體積，并使用不使用tips的Echo，將反應(yīng)體積縮小10倍，從10 μL減少到1 μL，成本降低了8倍。精準(zhǔn)減小實(shí)驗(yàn)體積更經(jīng)濟(jì)—— Echo微量化，縮小反應(yīng)體系，讓新技術(shù)更經(jīng)濟(jì)系統(tǒng)化的設(shè)計(jì)必然會(huì)帶來(lái)更大的樣本量，從而導(dǎo)致更高的費(fèi)用， Echo采用聲波的能量進(jìn)行無(wú)接觸式移液，且每滴液滴僅為2.5nL或25nL，因此可以直接省去吸頭耗材的消耗，也可以將檢測(cè)反應(yīng)體系降低4-100倍，使成本急劇下降。有效縮減試劑成本Gibson and Golden Gate Assembly實(shí)驗(yàn)：不同反應(yīng)體積的成本效益和組裝效率比較產(chǎn)品信息“僅用于科研，不用于臨床診斷”

2023-01-10 12:42:52貝克曼庫(kù)爾特Biomek NGeniuS與IDT文庫(kù)制備自動(dòng)化解決方案: 隨著基因組測(cè)序和數(shù)據(jù)分析方法的廣泛普及，越來(lái)越多的實(shí)驗(yàn)室正在探索下一代測(cè)序（Next-Generation Sequencing，NGS）作為研究工具的可行性。然而，NGS文庫(kù)的手動(dòng)制備過(guò)程單調(diào)乏味，根據(jù)所構(gòu)建文庫(kù)的類型而異，耗時(shí)從數(shù)小時(shí)到數(shù)天時(shí)間不等，并且操作過(guò)程中必須小心謹(jǐn)慎，以避免人工出錯(cuò)導(dǎo)致的制備失敗，浪費(fèi)寶貴樣本。Biomek NGeniuS系統(tǒng)是一款全自動(dòng)文庫(kù)制備系統(tǒng)，幫助我們從第一步即確保正確無(wú)誤。DNA樣品上機(jī)，撥動(dòng)轉(zhuǎn)盤，按下按鈕，運(yùn)行過(guò)程無(wú)需值守，每批次可支持運(yùn)行4-24任意數(shù)量的樣品，是實(shí)驗(yàn)室追求靈活性和自動(dòng)化的理想之選。圖1 Biomek NGeniuS全自動(dòng)文庫(kù)制備系統(tǒng)IDT xGen cfDNA & FFPE DNA Library Prep Kit 便是一款支持自動(dòng)化的試劑盒。該試劑盒提供高一致性的文庫(kù)制備方法，獨(dú)特的兩步連接法能夠有效抑制接頭二聚體和模板DNA自連，因而可有效提高文庫(kù)轉(zhuǎn)換率，尤其適用于cfDNA和FFPE等低質(zhì)量樣品，有助于研究人員發(fā)現(xiàn)和表征腫瘤樣品中出現(xiàn)的低頻變異位點(diǎn)。圖2 IDT xGen cfDNA & FFPE DNA Library Prep Kit工作流程我們使用Biomek NGeniuS系統(tǒng)對(duì)三種不同類型的樣品，cfDNA、FFPE和gDNA，分別構(gòu)建24個(gè)、10個(gè)和4個(gè)文庫(kù)。cfDNA 樣品所得文庫(kù)平均濃度為16.67ng/μL。cfDNA樣品連接后擴(kuò)增片段平均長(zhǎng)度為362bp，長(zhǎng)度分布一致且呈正態(tài)。與參考基因組相比，該樣品組從NGeniuS實(shí)驗(yàn)中獲得的所有文庫(kù)比對(duì)率為99.49%，配對(duì)的reads比對(duì)到參考基因組的比對(duì)率為99.84%。23份樣品中reads平均重復(fù)率為0.46%。圖3 以cfDNA為起始樣品，在Biomek NGeniuS 系統(tǒng)上使用IDT xGen cfDNA & FFPE DNA Library Prep Kit所制備文庫(kù)的分析結(jié)果。FFPE樣品構(gòu)建的文庫(kù)平均片段長(zhǎng)度為378 bp，長(zhǎng)度呈正態(tài)分布。與參考基因組相比，該樣品組從NGeniuS實(shí)驗(yàn)中獲得的所有文庫(kù)比對(duì)率為99.8%，配對(duì)的reads比對(duì)到參考基因組的比對(duì)率為99.84%。10份樣品中reads平均重復(fù)率為0.37%。圖4 以FFPE DNA為起始樣品，在Biomek NGeniuS 系統(tǒng)上使用IDT xGen cfDNA & FFPE DNA Library Prep Kit所制備文庫(kù)的分析結(jié)果。gDNA樣品制備的文庫(kù)平均片段長(zhǎng)度為391bp，長(zhǎng)度分布與 IDT xGen cfDNA & FFPE DNA Library Prep Kit 的預(yù)期一致。與參考基因組相比，該樣品組從 NGeniuS實(shí)驗(yàn)中獲得的所有文庫(kù)的比對(duì)率為99.2%，配對(duì)的reads比對(duì)到參考基因組的比對(duì)率為99.3%。3份樣品中reads平均重復(fù)率為0.56%。圖5 以gDNA為起始樣品，在Biomek NGeniuS 系統(tǒng)上使用IDT xGen cfDNA & FFPE DNA Library Prep Kit所制備文庫(kù)的分析結(jié)果。在Biomek NGeniuS全自動(dòng)文庫(kù)制備系統(tǒng)上使用IDT xGen cfDNA & FFPE DNA Library Prep kit構(gòu)建文庫(kù)，所得文庫(kù)片段大小分布一致，并符合IDT xGen cfDNA & FFPE DNA Library Prep Kit說(shuō)明書建議的文庫(kù)大小范圍。對(duì)三種不同濃度的樣品重復(fù)進(jìn)行測(cè)序，結(jié)果表明，平均文庫(kù)大小為362~391bp。所獲文庫(kù)比對(duì)率>99.2%，配對(duì)的reads比對(duì)到參考基因組的比對(duì)率>99.3%，重復(fù)率

2022-11-21 10:19:06“沃”的實(shí)驗(yàn) | 13份動(dòng)物模型構(gòu)建方法系列資料上新，造模不再難！: 在做基礎(chǔ)研究時(shí)加入動(dòng)物實(shí)驗(yàn)不僅會(huì)使研究工作更完善，也會(huì)提高投稿的命中率，但是想把實(shí)驗(yàn)做成功卻不是件容易的事兒，因?yàn)樵趧?dòng)物造模中總遇到各種難題：搞不清動(dòng)物建模標(biāo)準(zhǔn)化的流程，做起實(shí)驗(yàn)磕磕絆絆造模需要注意的細(xì)節(jié)多，反復(fù)摸索十幾遍才造模成功明明按照文獻(xiàn)中的實(shí)驗(yàn)方法造模，卻還老是不成功“沃”的實(shí)驗(yàn)全網(wǎng)最全的生命科學(xué)研究線上學(xué)習(xí)平臺(tái)第二期內(nèi)容：常見疾病動(dòng)物模型——構(gòu)建方法系列2幫助大家解決造模中遇到的難題第二期內(nèi)容有什么？“沃”的實(shí)驗(yàn)——全網(wǎng)最全的生命科學(xué)研究線上學(xué)習(xí)平臺(tái)第二期內(nèi)容，為大家分享常見疾病動(dòng)物模型構(gòu)建方法，涵蓋8大視頻課程+2大實(shí)驗(yàn)手冊(cè)+3大建模的標(biāo)準(zhǔn)操作流程。5位老師線上為你講解不同動(dòng)物模型的背景、造模方法等內(nèi)容，理論結(jié)合實(shí)踐，希望能給大家的動(dòng)物建模帶來(lái)更多新思路和新靈感。點(diǎn)擊鏈接，即可進(jìn)入學(xué)習(xí) 8大視頻課程 2大實(shí)驗(yàn)手冊(cè) 3大建模的標(biāo)準(zhǔn)操作流程歡迎大家收藏「“沃”的實(shí)驗(yàn)」線上學(xué)習(xí)平臺(tái)學(xué)習(xí)平臺(tái)，內(nèi)容將持續(xù)更新下期內(nèi)容預(yù)告：實(shí)驗(yàn)動(dòng)物手術(shù)操作-手術(shù)方法

2022-05-06 09:04:16多肽芯片能用在哪里？: 多肽芯片能用在哪里？多肽芯片是一種新型的生物芯片，是研究蛋白質(zhì)與蛋白質(zhì)或其他物質(zhì)（如核酸、多糖、化合物）之間相互作用最直觀的研究技術(shù)。多肽芯片在諸多領(lǐng)域中具有廣泛的應(yīng)用前景，如疫苗開發(fā)、藥物研發(fā)和篩選、臨床檢測(cè)以及蛋白質(zhì)的基礎(chǔ)功能研究。多肽芯片可用在抗原表位篩選、藥物開發(fā)及篩選、臨床檢測(cè)等。l 多肽芯片在抗原表位篩選方面體現(xiàn)出巨大的優(yōu)勢(shì)，可大量縮短開發(fā)時(shí)間，為前期的抗體篩選提供準(zhǔn)確的指標(biāo)和快速的反饋；l 多肽芯片為藥物開發(fā)及篩選提供有效的解決平臺(tái)，可有效提高新藥研發(fā)的成功功率，降低研發(fā)失敗的可能性，加快藥物研發(fā)進(jìn)程；l 現(xiàn)代醫(yī)療技術(shù)顯示，大多數(shù)疾病與蛋白質(zhì)表達(dá)異常有關(guān)，通過(guò)檢測(cè)患者樣本中的蛋白活性即可找到其發(fā)病機(jī)理，多肽芯片技為該難題提供了快捷的方法，使得對(duì)癥下藥成為可能。 Aurora提供多肽芯片的制備用到的微陣列點(diǎn)樣設(shè)備——多肽芯片點(diǎn)樣儀Aurora多肽芯片點(diǎn)樣儀采用化學(xué)固相合成法，可按需制備穩(wěn)定的多肽微陣列芯片，如新冠病毒原始毒株及其突變體奧密克戎S蛋白、N蛋白的微陣列芯片，更多產(chǎn)品詳情可進(jìn)一步了解產(chǎn)品價(jià)格或技術(shù)參數(shù)等信息，直接聯(lián)系A(chǔ)urora員。【內(nèi)容源自Aurorabiomed公眾號(hào)《多肽芯片為什么那么火？》，轉(zhuǎn)載請(qǐng)注明】Aurora集團(tuán)30年來(lái)致力于制造生物醫(yī)藥領(lǐng)域自動(dòng)化高通量設(shè)備。

2022-04-29 09:33:56什么是多肽芯片技術(shù)？: 什么是多肽芯片？多肽芯片是一種新型的生物芯片，是研究蛋白質(zhì)與蛋白質(zhì)或其他物質(zhì)（如核酸、多糖、化合物）之間相互作用最直觀的研究技術(shù)。多肽芯片在諸多領(lǐng)域中具有廣泛的應(yīng)用前景，如疫苗開發(fā)、藥物研發(fā)和篩選、臨床檢測(cè)以及蛋白質(zhì)的基礎(chǔ)功能研究。多肽芯片如何制備多肽芯片是將已知的蛋白序列或任意設(shè)計(jì)的氨基酸序列分解成包含重疊氨基酸的多肽片段，將這些多肽片段按一定次序固定在經(jīng)特殊處理過(guò)的載體基質(zhì)上，每張芯片包含成千上萬(wàn)甚至更多的肽鏈。將待測(cè)物與芯片反應(yīng)，經(jīng)過(guò)免疫檢測(cè)技術(shù)發(fā)現(xiàn)與待測(cè)物有結(jié)合反應(yīng)的位點(diǎn)/域，經(jīng)過(guò)圖像數(shù)據(jù)處理與分析，尋找蛋白質(zhì)/氨基酸與待測(cè)物的結(jié)合部位。多肽芯片技術(shù)及儀器l 多肽芯片技術(shù)可高通量點(diǎn)樣，多肽芯片上承載大量的多肽片段，可快速高效的找到相應(yīng)結(jié)合位點(diǎn)/域；l 點(diǎn)樣技術(shù)穩(wěn)定可靠，多肽芯片上固載的多肽片段包含蛋白全序列，相對(duì)于原大分子蛋白質(zhì)而言更穩(wěn)定，不易分解失活，采集的數(shù)據(jù)更為準(zhǔn)確；l 點(diǎn)樣靈活多樣，多肽片段可不局限于已知的蛋白結(jié)構(gòu)，構(gòu)成多肽分子的氨基酸可以是進(jìn)行過(guò)化學(xué)修飾的非天然氨基酸，在藥物研發(fā)和篩選方面具有很強(qiáng)的靈活性；l Aurora多肽芯片點(diǎn)樣儀：Aurora集團(tuán)30年來(lái)致力于制造生物醫(yī)藥領(lǐng)域自動(dòng)化高通量設(shè)備。Aurora多肽芯片點(diǎn)樣儀采用化學(xué)固相合成法，可按需制備穩(wěn)定的多肽微陣列芯片，如新冠病毒原始毒株及其突變體奧密克戎S蛋白、N蛋白的微陣列芯片，更多產(chǎn)品詳情可進(jìn)一步了解產(chǎn)品價(jià)格或技術(shù)參數(shù)等信息【內(nèi)容源自Aurorabiomed公眾號(hào)《多肽芯片為什么那么火？》，轉(zhuǎn)載請(qǐng)注明】