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轉化率99.8%!翌圣亞硫酸氫鹽轉化試劑盒重磅上市!

來源:翌圣生物科技(上海)股份有限公司      分類: 2024-12-25 14:38:25 26閱讀次數
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DNA甲基化是一種重要的表觀遺傳修飾,通過甲基化轉移酶的作用下,形成5-甲基胞嘧啶(5-mC);多項研究表明,DNA甲基化與腫瘤早期發生及腫瘤微小殘留相關,已成為極具潛力的早篩及MRD的標志物。


 
 
 
什么是亞硫酸氫鹽轉化?
弱酸性條件下,亞硫酸氫根結合到未甲基化的C堿基的6位,甲基化的C堿基不會結合。然后,通過堿處理,結合了亞硫酸氫根的非甲基化的C被脫氨基和脫亞硫酸根,成為U堿基。即,用亞硫酸氫鹽處理DNA可將胞嘧啶(C)轉化為尿嘧啶(U),但5-甲基胞嘧啶(5mC)不會發生轉變。

圖1 亞硫酸氫鹽轉化原理

 

 

亞硫酸氫鹽轉化的前世今

1970年萌芽期
 
  • Hayats等發現了胞嘧啶可以通過亞硫酸氫鹽脫氨基且5-甲基胞嘧啶通過亞硫酸氫鹽脫氨基的速度遠遠比非甲基化的胞嘧啶慢。

  • 這些研究結果提示亞硫酸鹽使 DNA中未發生甲基化的胞嘧啶(C)脫氨基轉變成尿嘧啶(U),而甲基化的胞嘧啶保持不變,通過PCR反應轉化成胸腺嘧啶(T)。

1992年發展期
 
  • 科學家們將亞硫酸氫鹽轉化的轉化時間縮短至18h,轉化率可達99%;

  • 在NGS技術還未到來之前,亞硫酸氫鹽轉化已被廣泛使用,但檢測的甲基化位點有限。

Now成熟期
 
  • 隨著NGS技術的發展,WGBS及RRBS等甲基化檢技術的問世,甲基化的研究進入一個新紀元,可以實現高通量、單堿基的甲基化分辨率。

  • 通過不斷的技術的革新,加上先進的柱膜技術或超順磁性氧化硅納米磁珠,亞硫酸氫鹽轉化時間可短至90min之內,轉化率可達99.5%以上。

 

 
亞硫酸氫鹽轉化-DNA甲基化檢測的“金標準”
近幾年,基于DNA甲基化位點的檢測試劑盒陸續獲批面世。NMPA批準的甲基化檢測試劑盒大部分為熒光PCR法,主要原因在于熒光PCR法操作簡便,無需在PCR后電泳,且具有靈敏度高、特異性強、重復性好等特點。這些甲基化檢測試劑采用的轉化方法為亞硫酸氫鹽轉化法,亞硫酸氫鹽轉化成為DNA甲基化檢測的“金標準”。
2023年,NMPA陸續獲批了多個甲基化檢測試劑盒,甲基化檢測領域持續炙手可熱!

 

表1.2023 NMPA獲批甲基化檢測產品

(更多的獲批產品可于NMPA官網查詢)

 

翌圣生物自主研發的超高轉化率亞硫酸氫鹽轉化試劑,助力腫瘤早篩!

 

 

產品介紹

Hieff® Mag DNA Methylation Bisulfite Kit(Cat#12223)磁珠法DNA甲基化亞硫酸氫鹽轉化試劑盒能轉化未發生甲基化的胞嘧啶,通過脫氨基反應產生尿嘧啶磺酸鹽,發生甲基化的胞嘧啶則不會被亞硫酸氫鹽轉化。轉化后的DNA經過高效吸附核酸的磁珠結合,再通過洗滌、脫硫和洗脫等步驟富集得到磁珠上的DNA。

 

 

產品優勢

 

產品性能
 
非甲基化C的轉化率:
 
 
糞便脫落細胞gDNA、cfDNA 、FFPE DNA不同投入量進行亞硫酸氫鹽轉化,樣本中參入1%λDNA和0.5% PUC19DNA,12223ES的轉化率>99.5%,5ng以上的樣本投入量,轉化率>99.8%

 

圖2 非甲基化C的轉化率

 

 
甲基化C的保護率:
 
 
糞便脫落細胞gDNA、cfDNA 、FFPE DNA不同投入量進行亞硫酸氫鹽轉化,樣本中參入1%λDNA和0.5% PUC19DNA,12223ES甲基化C的保護率>98%。

 

圖3 甲基化C的保護率

 

 
線性關系:
 
 

293T gDNA不同投入量進行亞硫酸氫鹽轉化,轉化后的DNA采用甲基化特性行引物進行qPCR,不同樣本投入量之間具有良好的線性關系。

圖4.不同樣本投入量轉化率之間的線性關系

 

 
批間穩定性:
 
 
采用3個不同批次的試劑,以293T gDNA不同投入量進行亞硫酸氫鹽轉化,轉化后進行NGS測序,3個批次間的轉化率和保護率具有良好的重復性

表2 不同批次試劑的轉化率

 

 
弱陽性臨床樣本的檢出情況:
 
 

采用3個腸癌弱陽性的糞便樣本,轉化后的DNA采用SDC2甲基化特性行引物進行qPCR,12223ES轉化的檢測體系擁有更高的靈敏度。

圖5 SDC2甲基化特異性引物qPCR檢測結果

 

 

訂購信息

 

產品名稱

產品貨號

產品應用

Hieff® Mag DNA Methylation Bisulfite Kit(Cat#12223)磁珠法DNA甲基化亞硫酸氫鹽轉化試劑盒

12223ES

甲基化轉化

 

相關產品

 

產品名稱

產品貨號

產品應用

Hieff NGS® Methyl-seq DNA library Prep kit for Illumina® V2

甲基化DNA建庫試劑盒V2

12221ES

甲基化文庫構建

DNA Methylation Bisulfite Kit  DNA重亞硫酸鹽轉化試劑盒

12222ES

甲基化轉化

ssDNA Assay Kit

12645ES

單鏈 DNA(ssDNA)定量

1×dsDNA HSAssay Kit

12642ES

雙鏈DNA(dsDNA)定量

Hieff NGS® RNA 384 CDI Primer for Illumina® , Set 1-2

 

12414ES

12415ES

Index

Hieff Canace® Uracil+ High-Fidelity DNA polymerase

10145ES

甲基化轉化后PCR擴增

 

 

 

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最近更新:2024-12-18 14:04:41
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